ジャージ部と名乗る奇妙な部活の部長でもあり、唯一の部員である京乃まどかは人助け大好き少女。そんな彼女は宇宙人の少女ランからの頼みを受けて、移動型地球防衛基地ファロスに搭載された機体ウォクス・アウラのパイロットに選ばれてしまう。そこにもう一人の宇宙人・ムギナミが加わり、彼女達3人はジャージ部としてウォクスシリーズのパイロットとしての二足のわらじで鴨川市の命運を守っていく……。