全宇宙の征服を目論むベガ星はフリード星を襲撃。滅んだフリード星からスぺイザーとともに逃げ延びた王子・デュークフリード。彼は宇宙科学研究所の宇門源蔵博士の養子・大介として白樺牧場の仲間たちとともに地球での平和な暮らしを満喫していた。
　だが、ベガ星の魔の手は地球へ伸びてきた。戦いを嫌う大介だが、デュークとしてフリード星の守護神グレンダイザーとともに立ち上がった。
　デュークとグレンダイザーの戦いは戦いと無縁だった人物を巻き込み、敵でありながら悲しい宿命を背負った戦士を散らしていく。だが、第二の故郷地球をベガ星の二の舞にしてはいけない!戦えグレンダイザー!!