ロボット同士で戦わせるバトロボマッチが大ブームのこの世界。バトロボの第一人者・ハジメ博士の孫・曙アキラはバトロボコマンダーの頂点・タイタンクラウザーを目指す少年コマンダーだ。
　心を通わせて力を発揮するクラスターシステムを搭載したバトロボ・リューグ、博士の開発したアニマルユニット・ダイノユニットのバトロボとともにバトロボマッチでさまざまな強敵に勝ち抜いていく。
　だがバトロボを制して社会を支配するプロフェッサー・ビッグバン、バトロボだけの楽園を築きあげようと企むドラゴバーストの影がチームアキラに迫る。