人類が宇宙へ進出し始めた西暦2050年。エルダー星人は風見博士が開発したトリニティエネルギーを狙って地球へ攻撃を開始した。だが風見博士は有事に備えて宇宙開発用に完成させた空雷王、海鳴王、陸震王の3機をスーパーロボット・宇宙大帝ゴッドシグマへ合体できるように改造していた。
　ゴッドシグマを駆りエルダー軍の送り出すコスモザウルスを次々と片付ける闘志也、ジュリィ、キラケン。だがエルダー軍は何故地球を、トリニティエネルギーを手にする必要があったのか。エルダー軍の真実を知る時、事態は思わぬ方向へ傾いていく……。